Son directamente intercambiables en términos de distribución de pines. Es decir, cada pin corresponde al mismo elemento del doble diodo de la válvula. Esto lo puedes observar aquí:
5V4GA:
http://tdsl.duncanamps.com/show.php?des=5V4GA
5Y3:
http://tdsl.duncanamps.com/show.php?des=5Y3
GZ34:
http://tdsl.duncanamps.com/show.php?des=GZ34
Lo que si notarás es que tienen diferente anatomía. La 5V4GA y la GZ34 calientan el cátodo de manera indirecta, mientras que la 5Y3 tiene el cátodo separado del filamento de la válvula.
Esto no tiene grandes implicaciones, pero la caída de tensión que generará cada rectificadora será distinta, siendo la 5Y3 la que debería causar una mayor caída de tensión (siempre que sea de producción NOS, las actuales no tienen tanta caída). Esto si es importante, porque si utilizas (por ejemplo) la GZ34 en el lugar de la 5Y3, el voltaje de placa subirá, y dependiendo del ampli, puedes llevar las válvulas fuera de su zona de funcionamiento (subir el bias) o causar el fallo de algún componente que no aguante tanto voltaje (lo mas común es que sean los condensadores de filtro de la fuente de alimentación).